第285章 这还是化学问题吗(1 / 5)
“我们接下来需要做的事很明確,根据这组模型输出的数学约束条件,逆向设计出全新的蛋白质骨架。”
徐铭站在主讲位置,身后的屏幕中,显示出多尺度动態计算模型,通过超级计算机不间断演算一个月,最终输出的理想活性口袋约束条件。
现场眾人中,国际数学挑战研究院议题组员,因为早已经看到过这项约束条件。
神情上並无多少变化。
反观化学研究所这边,包括周启深院士在內,大家都下意识微皱眉头。
儘管他们在极紫外光刻胶后,都愿意相信徐铭。
认为酶催化,並非现代化学的绝症,是能够將其成功解决的。
但看到屏幕上面,那一系列拓扑描述符,与静电势等高线图和氢键网络连接矩阵,以及用张量表示的金属配位场参数条件。
儼然已经超出了化学表达范围。
“这真的还是化学问题吗?”坐在化学所中间的路川忍不住低喃一句。
仿佛对构建全新蛋白质结构的难度有了一个认知。
显然並非一件容易的事。
徐铭讲述时,也在注意著大家的表现,前脚话音落下未做停顿,便又用化学语言对约束条件进行讲解。
“周院。”
“根据模型输出的约束条件,需要一个大约150个胺基酸的小蛋白,它要能在水溶液中稳定摺叠,核心有一个直径0.8纳米的疏水口袋。”
“口袋內壁的静电势梯度必须满足这个函数。”
讲到这里,徐铭快速切换画面。
下秒一条复杂的曲线出现。
“在坐標x=0.2纳米处,电势要为-15毫伏;x=0.5纳米处,转为+8毫伏;
“口袋最深处金属簇的结合位点,电势必须接近零。”
隨著他的讲解,周启深等人陷入思考状,目光牢牢注视著屏幕满脸认真。
而就在这时,路川嘴唇微动,略作犹豫还是选择了主动开口搭话。
“徐院长。”
“天然固氮酶的活性口袋,似乎並没有这么精確的静电梯度?”
说出自己心中的疑问。
徐铭把这句话听进耳中,顿时投去一个欣慰眼神。
接著嘴角爬上笑容,沉声给予回答。
“因为天然酶不需要。”
“我们的动態计算模擬显示,二氧化碳分子在进入活性口袋时,其碳氧键的极化程度会隨著位置变化。”
“这个静电梯度是为了在特定位置『拉伸』碳氧键,降低其断裂能垒。” ↑返回顶部↑
徐铭站在主讲位置,身后的屏幕中,显示出多尺度动態计算模型,通过超级计算机不间断演算一个月,最终输出的理想活性口袋约束条件。
现场眾人中,国际数学挑战研究院议题组员,因为早已经看到过这项约束条件。
神情上並无多少变化。
反观化学研究所这边,包括周启深院士在內,大家都下意识微皱眉头。
儘管他们在极紫外光刻胶后,都愿意相信徐铭。
认为酶催化,並非现代化学的绝症,是能够將其成功解决的。
但看到屏幕上面,那一系列拓扑描述符,与静电势等高线图和氢键网络连接矩阵,以及用张量表示的金属配位场参数条件。
儼然已经超出了化学表达范围。
“这真的还是化学问题吗?”坐在化学所中间的路川忍不住低喃一句。
仿佛对构建全新蛋白质结构的难度有了一个认知。
显然並非一件容易的事。
徐铭讲述时,也在注意著大家的表现,前脚话音落下未做停顿,便又用化学语言对约束条件进行讲解。
“周院。”
“根据模型输出的约束条件,需要一个大约150个胺基酸的小蛋白,它要能在水溶液中稳定摺叠,核心有一个直径0.8纳米的疏水口袋。”
“口袋內壁的静电势梯度必须满足这个函数。”
讲到这里,徐铭快速切换画面。
下秒一条复杂的曲线出现。
“在坐標x=0.2纳米处,电势要为-15毫伏;x=0.5纳米处,转为+8毫伏;
“口袋最深处金属簇的结合位点,电势必须接近零。”
隨著他的讲解,周启深等人陷入思考状,目光牢牢注视著屏幕满脸认真。
而就在这时,路川嘴唇微动,略作犹豫还是选择了主动开口搭话。
“徐院长。”
“天然固氮酶的活性口袋,似乎並没有这么精確的静电梯度?”
说出自己心中的疑问。
徐铭把这句话听进耳中,顿时投去一个欣慰眼神。
接著嘴角爬上笑容,沉声给予回答。
“因为天然酶不需要。”
“我们的动態计算模擬显示,二氧化碳分子在进入活性口袋时,其碳氧键的极化程度会隨著位置变化。”
“这个静电梯度是为了在特定位置『拉伸』碳氧键,降低其断裂能垒。” ↑返回顶部↑