第285章 这还是化学问题吗(4 / 5)
成功合成需要的人工酶。
感受著徐铭语气中散发出的自信和胸有成竹,周启深也不由得鬆了口气。
身上自己给自己的压力,顿时减轻许多。
“看来今晚我是来对了,真让人期待啊!”周启深脸上堆出灿烂笑容。
翌日。
徐铭同全体议题组员,接入超算中心会议室,把初步设计方案序列,输入到模型的快速评估模块。
“序列正在输入。”
“筛选標准为,摺叠自由能低於-8.0千卡每摩尔,金属簇结合能预测值低於-12.0,底物结合通道在分子模擬中至少保持开放10纳秒。”
“计算开始。”
房间內两地同步播报声音响起,两千个设计被转化为数学模型。
在数字宇宙中经歷严酷的演化压力。
有些序列理论上根本无法摺叠;有些能摺叠,但形成的口袋形状偏离要求;有些虽能结合金属簇,但静电梯度完全错误。
伴隨著一个个设计被筛选出局,留下可行性最高的极少部分方案。
整个快速筛选共持续了十二个小时。
眾人一直待到了晚上九点,终於拿到筛选结果。
“徐院。”
“根据报告显示,在所有设计中,有13个在100纳秒模擬中保持了结构完整性。”
“金属簇稳定结合,底物通道保持开放。”
路川强忍著心中剧烈的情绪波动,当著全体组员的面向徐铭匯报,关於超级计算机对设计的筛选结果。
在这13个通过筛选的设计中,很有可能就存在,实现酶催化所需的全新蛋白质结构。
关键仅用了半个多月时间,就走到了这一步,放到以前他参与项目时,可以说连想都不敢想。
偏偏徐铭將其变成了现实。
当然他非常清楚,之所以能快速筛选,要归功於徐铭除数学和化学之外的信息算法水平,否则换成別人想把这些设计从两千筛选到十几个,花费几年时间在数学界都是件很正常不过的事情。
甚至最终还得不到一个好的结果。
对於这份报告,周启深同样喜不胜收,下秒接过报告激动的搭话。
“可以开始合成了。”
“十三个序列,依次做密码子优化,合成基因,构建表达载体。”
然就在他话音落下的同时,却见位於主座的徐铭摇了摇头提出不同意见。
“还是太慢了,要做二轮筛选。”
“二轮筛选?”周启深眼神中流露出惊讶。 ↑返回顶部↑
感受著徐铭语气中散发出的自信和胸有成竹,周启深也不由得鬆了口气。
身上自己给自己的压力,顿时减轻许多。
“看来今晚我是来对了,真让人期待啊!”周启深脸上堆出灿烂笑容。
翌日。
徐铭同全体议题组员,接入超算中心会议室,把初步设计方案序列,输入到模型的快速评估模块。
“序列正在输入。”
“筛选標准为,摺叠自由能低於-8.0千卡每摩尔,金属簇结合能预测值低於-12.0,底物结合通道在分子模擬中至少保持开放10纳秒。”
“计算开始。”
房间內两地同步播报声音响起,两千个设计被转化为数学模型。
在数字宇宙中经歷严酷的演化压力。
有些序列理论上根本无法摺叠;有些能摺叠,但形成的口袋形状偏离要求;有些虽能结合金属簇,但静电梯度完全错误。
伴隨著一个个设计被筛选出局,留下可行性最高的极少部分方案。
整个快速筛选共持续了十二个小时。
眾人一直待到了晚上九点,终於拿到筛选结果。
“徐院。”
“根据报告显示,在所有设计中,有13个在100纳秒模擬中保持了结构完整性。”
“金属簇稳定结合,底物通道保持开放。”
路川强忍著心中剧烈的情绪波动,当著全体组员的面向徐铭匯报,关於超级计算机对设计的筛选结果。
在这13个通过筛选的设计中,很有可能就存在,实现酶催化所需的全新蛋白质结构。
关键仅用了半个多月时间,就走到了这一步,放到以前他参与项目时,可以说连想都不敢想。
偏偏徐铭將其变成了现实。
当然他非常清楚,之所以能快速筛选,要归功於徐铭除数学和化学之外的信息算法水平,否则换成別人想把这些设计从两千筛选到十几个,花费几年时间在数学界都是件很正常不过的事情。
甚至最终还得不到一个好的结果。
对於这份报告,周启深同样喜不胜收,下秒接过报告激动的搭话。
“可以开始合成了。”
“十三个序列,依次做密码子优化,合成基因,构建表达载体。”
然就在他话音落下的同时,却见位於主座的徐铭摇了摇头提出不同意见。
“还是太慢了,要做二轮筛选。”
“二轮筛选?”周启深眼神中流露出惊讶。 ↑返回顶部↑