第5章 导师的惊讶,有望发表顶级期刊(2 / 3)
每一种全新的分析方法构建,都需要非常庞大的计算资源,以及长期大量的临床检验场景的数据支持。
属於一种繁琐又精细的科研项目。
原本打算斥责一番。
但隨著对方写论文的逐渐呈现出来,他竟然感觉到了一丝醍醐灌顶的错觉。
这学生改进的算法从思路上看,並没有什么大问题。
甚至连模擬数据都跑出来了……
“嗯,老师,我最近做的基因重组实验,正好运用到较多的blast,这种工具分析基因数据太过繁琐了,大部分的实验都用在了基因组的解析上面。”
“所以我就有了一种想法,改进一下blast工具,创造一种更高效的分析工具。”
李涧回答道,这是他早就想好的说法。
不过为了堵住这个说法之中的漏洞,他最近需要好好的恶补一下数学跟编程方面的知识。
“模擬数据看上去倒是没有多大的问题,充当毕业论文足够了,但那可就太可惜了。”
“如果补全临床数据,彻底的验证你论文模擬数据之中的结论正確可行的话,足以发表一篇顶刊。
你加我一下微信,回头我將隔壁医学院的同学推给你,你自己联繫一下,沟通临床研究的事情!”
周靖学拿出手机,打开了微信扫一扫递了过来。
李涧迅速的拿出手机打开了微信,加上了好友。
“过程中遇到什么问题都可以来找我,或者找程颐,他是我手底下的博士生,算是你们的大师兄。”
“不错,好好努力,论文写好了,我可以帮你看看。”
周靖学听到了微信好友通过的提示音后,拍了拍李涧的肩膀,笑著说道,一改平常冷脸待人的模样,变得十分的宽和。
原本不打算带本科生了,但是学校那边已经安排下来,他也没有拒绝。
没想到竟然遇到一个不错的苗子。
根据李涧所写的模擬数据来看,论文所改进的算法完全具备可行性。
从他对这份数据的处理来看,在基因重组方面的知识比一些硕士研究生都要深入一些。
现有的blast生物大分子对比工具是大洋对面的世界第一大国国家生物技术信息中心研究出来的顶尖工具,目前市场上主流的生物大分子比对工具。
国內也有,但是相比blast的功能方面还差了一些,还有很长的路要要追赶。
在临床治疗中分析病原微生物的工具,如果仅仅是已知的核酸测序的数据分析的话,大约十来分钟就能够搞定。
確定好病原体就能够对症下药。
但是如果是陌生未知的病原体,需要进行完整的基因库建库最少需要十多个小时。
其中涉及到测序、数据標准化注释、功能性验证、临床关联性分析、数据入库等等工序,非常的复杂。
难一点的病原体甚至需要数天乃至上月的时间进行测序建库工作。
比如前些年刚刚发现的病毒,就花费了好几天的时间才確定完整的基因库。 ↑返回顶部↑
属於一种繁琐又精细的科研项目。
原本打算斥责一番。
但隨著对方写论文的逐渐呈现出来,他竟然感觉到了一丝醍醐灌顶的错觉。
这学生改进的算法从思路上看,並没有什么大问题。
甚至连模擬数据都跑出来了……
“嗯,老师,我最近做的基因重组实验,正好运用到较多的blast,这种工具分析基因数据太过繁琐了,大部分的实验都用在了基因组的解析上面。”
“所以我就有了一种想法,改进一下blast工具,创造一种更高效的分析工具。”
李涧回答道,这是他早就想好的说法。
不过为了堵住这个说法之中的漏洞,他最近需要好好的恶补一下数学跟编程方面的知识。
“模擬数据看上去倒是没有多大的问题,充当毕业论文足够了,但那可就太可惜了。”
“如果补全临床数据,彻底的验证你论文模擬数据之中的结论正確可行的话,足以发表一篇顶刊。
你加我一下微信,回头我將隔壁医学院的同学推给你,你自己联繫一下,沟通临床研究的事情!”
周靖学拿出手机,打开了微信扫一扫递了过来。
李涧迅速的拿出手机打开了微信,加上了好友。
“过程中遇到什么问题都可以来找我,或者找程颐,他是我手底下的博士生,算是你们的大师兄。”
“不错,好好努力,论文写好了,我可以帮你看看。”
周靖学听到了微信好友通过的提示音后,拍了拍李涧的肩膀,笑著说道,一改平常冷脸待人的模样,变得十分的宽和。
原本不打算带本科生了,但是学校那边已经安排下来,他也没有拒绝。
没想到竟然遇到一个不错的苗子。
根据李涧所写的模擬数据来看,论文所改进的算法完全具备可行性。
从他对这份数据的处理来看,在基因重组方面的知识比一些硕士研究生都要深入一些。
现有的blast生物大分子对比工具是大洋对面的世界第一大国国家生物技术信息中心研究出来的顶尖工具,目前市场上主流的生物大分子比对工具。
国內也有,但是相比blast的功能方面还差了一些,还有很长的路要要追赶。
在临床治疗中分析病原微生物的工具,如果仅仅是已知的核酸测序的数据分析的话,大约十来分钟就能够搞定。
確定好病原体就能够对症下药。
但是如果是陌生未知的病原体,需要进行完整的基因库建库最少需要十多个小时。
其中涉及到测序、数据標准化注释、功能性验证、临床关联性分析、数据入库等等工序,非常的复杂。
难一点的病原体甚至需要数天乃至上月的时间进行测序建库工作。
比如前些年刚刚发现的病毒,就花费了好几天的时间才確定完整的基因库。 ↑返回顶部↑