第135章 黎明前的测序(7 / 8)
没有引物二聚体,没有非特异性扩增。
“漂亮!”陈浩忍不住挥了一下拳头。
江河:“准备测序反应,用纯化柱回收pcr產物,加入bigdye测序试剂,进行测序pcr。”
又是一轮精密操作。
上午10:00。
阳光已经彻底照亮了羊城的天空。
孙长明的实验室里,所有人围在abi 3130xl基因分析仪的电脑屏幕前。
测序的毛细管电泳正在进行最后的信號读取。
屏幕上开始逐一出现不同顏色的萤光峰。
红色、绿色、蓝色、黑色,分別代表著a、t、c、g四种碱基。
“出峰了,基线很平,峰型极其尖锐,测序质量极高。”程溪瑶紧盯著屏幕,眼睛一眨不眨。
隨著测序仪的运行,一长串的碱基序列被读取出来,生成了fasta格式的文本文件。
“导出序列数据,陈浩,打开电脑里的blast比对软体。”
陈浩立刻將生成的ha、na、m三个基因片段的序列文件导入本地构建好的流感病毒资料库中进行相似度比对。
进度条快速拉满。
比对结果弹了出来。
陈浩看著屏幕上的英文和数据,愣住了。
“老江……这……这不对啊,这资料库是不是坏了?”
“怎么了?”
“它的ha基因片段,比对出来最相似的是……北美古典猪流感病毒?它的na和m片段,比对出来是欧亚类禽猪流感病毒?然后……它的pb1基因怎么又和人类季节性h3n2流感病毒高度同源?”
陆晓林摇头:“这不可能,猪的病毒、禽类的病毒、人类的病毒……怎么会全部拼凑在同一个病毒株里?我们做错了。”
大家都有些失望。
只有江河,长长地吐出了一口浊气。
——成了。
至於为什么?
原因很简单。
当猪同时感染了禽流感、人流感和猪流感病毒时,它的呼吸道上皮细胞就像是一个天然的混合器。
不同的病毒在这里发生了基因重排,最终诞生了这个集三家之长、对人类有著致命威胁的全新变异体——
甲型h1n1流感病毒。
江河轻声道:“资料库没坏,这是一种前所未见的四重重配新型流感病毒,人类的免疫系统对它完全陌生。” ↑返回顶部↑
“漂亮!”陈浩忍不住挥了一下拳头。
江河:“准备测序反应,用纯化柱回收pcr產物,加入bigdye测序试剂,进行测序pcr。”
又是一轮精密操作。
上午10:00。
阳光已经彻底照亮了羊城的天空。
孙长明的实验室里,所有人围在abi 3130xl基因分析仪的电脑屏幕前。
测序的毛细管电泳正在进行最后的信號读取。
屏幕上开始逐一出现不同顏色的萤光峰。
红色、绿色、蓝色、黑色,分別代表著a、t、c、g四种碱基。
“出峰了,基线很平,峰型极其尖锐,测序质量极高。”程溪瑶紧盯著屏幕,眼睛一眨不眨。
隨著测序仪的运行,一长串的碱基序列被读取出来,生成了fasta格式的文本文件。
“导出序列数据,陈浩,打开电脑里的blast比对软体。”
陈浩立刻將生成的ha、na、m三个基因片段的序列文件导入本地构建好的流感病毒资料库中进行相似度比对。
进度条快速拉满。
比对结果弹了出来。
陈浩看著屏幕上的英文和数据,愣住了。
“老江……这……这不对啊,这资料库是不是坏了?”
“怎么了?”
“它的ha基因片段,比对出来最相似的是……北美古典猪流感病毒?它的na和m片段,比对出来是欧亚类禽猪流感病毒?然后……它的pb1基因怎么又和人类季节性h3n2流感病毒高度同源?”
陆晓林摇头:“这不可能,猪的病毒、禽类的病毒、人类的病毒……怎么会全部拼凑在同一个病毒株里?我们做错了。”
大家都有些失望。
只有江河,长长地吐出了一口浊气。
——成了。
至於为什么?
原因很简单。
当猪同时感染了禽流感、人流感和猪流感病毒时,它的呼吸道上皮细胞就像是一个天然的混合器。
不同的病毒在这里发生了基因重排,最终诞生了这个集三家之长、对人类有著致命威胁的全新变异体——
甲型h1n1流感病毒。
江河轻声道:“资料库没坏,这是一种前所未见的四重重配新型流感病毒,人类的免疫系统对它完全陌生。” ↑返回顶部↑